Obsah
Začať proces identifikácie neznámych baktérií sledovaním ich fyzikálnych vlastností, ako sú bunková stena, tvar a väzby. Na ďalšie zúženie identifikácie používajte štandardné laboratórne postupy, ako je farbenie buniek, kultivácia a sekvenovanie DNA. Baktérie sa spravidla zoskupujú do druhov podľa ich fyzikálnych a metabolických charakteristík, a nie podľa ich genetických vzťahov k sebe navzájom.
Pozitívne alebo negatívne
Eubaktérie sú tzv. Pravé baktérie.Sú odlišné od archaea alebo archaebacteria, ktoré tvoria samostatné kráľovstvo. Eubaktérie sú prokaryoty, čo znamená, že im chýba jadrová membrána. Väčšina z nich má bunkové membrány a bunkové steny. Baktérie so silnými bunkovými stenami sa označujú ako grampozitívne, pretože počas testu nazývaného Gramovo farbenie sú náchylné na smrť. Gramovo farbenie je prvým testom použitým pri klasifikácii baktérií. Baktérie s tenkými alebo chýbajúcimi bunkovými stenami sú gramnegatívne, pretože nezachytávajú Gramovo farbivo.
Formovanie baktérií
Sférické baktérie sa nazývajú koky, baktérie, ktoré tvoria rovné tyčinky, sa nazývajú bacily a baktérie so stredným tvarom sa nazývajú kokobacily. Všetky môžu byť gramnegatívne alebo grampozitívne. Pevné, špirálovité baktérie sú známe ako spirilla a sú iba gramnegatívne. Flexibilné, nezávisle mobilné, špirálovito tvarované baktérie sa nazývajú spirochéty a sú gram-neutrálne. Nakoniec sa tuhé tyčinky v tvare čiarky nazývajú vibrácie a sú gramnegatívne. Niekoľko málo známych a zle pochopených baktérií má rôzne tvary, ako napríklad hviezdicová stella a sekera v tvare labry. Existujú tiež dve prechodné bakteriálne skupiny. Rickettsia je podobná vírusom, má rôzne tvary, je gramnegatívna a môže prežiť iba v iných bunkách. Mykoplazmy, ktoré sú podobné hubám, nemajú bunkové steny a zahŕňajú mnoho druhov špecifických pľúcnych patogénov spôsobujúcich zápal pľúc.
Kocky, zhluky a ďalšie prepojenia
Cocci a bacily sa ďalej klasifikujú podľa väzieb, ktoré tvoria po delení buniek. Diplococci a diplobacilli držia spolu v pároch. Streptokoky a streptobacily tvoria reťazce. Tetradské koky zostávajú na štvorcoch štyroch baktérií. Sarcinae cocci tvoria osembakteriálne kocky a stafylokoky tvoria zhluky.
Identifikácia baktérie
Ak máte neznámu baktériu a chcete ju identifikovať, spravidla vykonáte farbenie gramom a potom pozorujete vzhľad kolónií a jednotlivé vlastnosti. V tom okamihu môžete povedať, že máte napríklad gramnegatívny, aeróbny streptobacil. Potom môžete svoju vzorku porovnať s rôznymi známymi baktériami umiestnením na rôzne kultivačné médiá, ktoré podporujú rast niektorých druhov a inhibovať iné, alebo testovaním vzorky na rôzne známe bakteriálne vedľajšie produkty. Ako posledné riešenie môže sekvenovanie DNA určiť, či máte známy alebo neznámy bakteriálny druh alebo kmeň, za predpokladu, že ho porovnáte s druhom alebo kmeňom, ktorého genóm už bol sekvenovaný.