Obsah
- Riedenie vzoriek, pokovovanie a inkubácia
- Ručné počítanie
- Automatické počítanie
- Zkomplikovanie počítania
Jedným z klasických spôsobov stanovenia koncentrácie mikróbov vo vzorke je zriedenie vzorky, rast mikróbov na platniach a spočítanie kolónií. Potiahnuté mikróby rastú z jednotky tvoriacej kolónie pozostávajúcej z jednej alebo viacerých buniek do viditeľnej kolónie, ktorú je možné vidieť a spočítať. Baktérie sú najbežnejším mikróbom, ktorý sa hodnotí pomocou počtu doštičiek. Počty kolónií sa používajú na detekciu a počítanie mikróbov v pôde, vode a potrave. Protokoly na počítanie kolónií zdôrazňujú presný a metodický prístup.
Riedenie vzoriek, pokovovanie a inkubácia
Ak na agarovú platňu jednoducho natriete vzorku mikróbov, uvidíte toľko jednotiek tvoriacich kolónie, že sa jednotlivé kolónie zmiešajú, čo znemožňuje ich spočítanie. Ak chcete tento problém vyriešiť, zmiešajte vzorku do tekutého média, odoberte malé množstvo tejto zmesi a ďalej ju zrieďte. Tento postup opakujte šesť až desaťkrát. Nakoniec naneste konečné riedenie na agarovú platňu a inkubujte ho štyri až sedem dní, kým spočítate kolónie.
Ručné počítanie
Primárnym trikom pri počítaní kolónií je spočítať každú bodku kolónie raz. Jedným z prístupov je nastavenie Petriho misky na pozadí mriežky a spočítanie kolónií v každej bunke mriežky, pričom sa postupuje metodickým vzorcom cez všetky bunky. Užitočným prístupom môže byť aj označovanie počítaných kolónií na zadnej strane Petriho misky. Spravidla budete musieť spočítať najmenej tri platne; navrhuje sa iba použitie platní obsahujúcich 30 až 300 kolónií, aby sa urobili spoľahlivé závery, navrhuje Microbiology Network, spoločnosť, ktorá poskytuje konzultačné služby laboratóriám a výrobcom. Doštičky s kolóniami, ktoré sú príliš početné na to, aby sa dali počítať, alebo s príliš malým počtom kolónií, sa musia znovu naniesť na nové riedenie.
Automatické počítanie
Ľudská chyba zvyšuje čas potrebný na manuálne počítanie kolónií. Aby sa zvýšila presnosť aj účinnosť, vložte Petriho misku do automatizovaného zariadenia na počítanie kolónií. Automatizované počítadlá kolónií vyfotia misku, oddelia kolónie od pozadia a potom pomocou algoritmu spočítajú kolónie na doštičke. Algoritmy môžu mať ťažkosti s rozlišovaním kolónií, keď sa dve alebo viac kolónií dotýkajú okrajov, takže je to oblasť pokračujúceho vývoja softvéru.
Zkomplikovanie počítania
Presnosť výpočtu hustoty mikróbov z počtu kolónií má určité obmedzenia. Jednotkami tvoriacimi kolónie môže byť jediná bunka, reťazec buniek alebo celá skupina buniek. Predpokladá sa, že kolónia predstavuje jednu bunku, takže koncentrácie vypočítané z počtu kolónií môžu byť nízke. Rôzne mikróby potrebujú rôzne podmienky rastu a kolónie na doštičke predstavujú iba tie mikróby, ktoré prosperujú na tomto rastovom médiu za týchto inkubačných podmienok. Okrem toho sa pri počítaní kolónií nezaznamenávajú odumreté bunky, čo je dôležité pri potrebe koncentrácie buniek v pôvodnej vzorke.