Obsah
- Všeobecná extrakcia DNA
- Rastlinné a živočíšne bunky
- Extrakcia rastlinnej DNA
- Extrakcia živočíšnej DNA
- Rozdiely v DNA
Štruktúra dvojvláknovej DNA je univerzálna vo všetkých živých bunkách, vyskytujú sa však rozdiely v metódach extrakcie genómovej DNA zo živočíšnych a rastlinných buniek. Aj keď genómová DNA žije v jadre buniek, množstvo a čistota extrahovanej DNA závisí od typu a veľkosti bunky. Napríklad niektoré bunky obsahujú viac DNA a nečistôt ako iné. Čítajte ďalej a získajte viac informácií o rozdieloch v extrakcii DNA.
Všeobecná extrakcia DNA
Ak ošetrujete rastlinné a živočíšne bunky mydlovou látkou, odbúravajú tuky v bunke a v jadrových membránach. Potom sa zmes DNA oddelí od bunkových membrán a proteínov. Ďalej môžete na vyzrážanie DNA v roztoku použiť alkohol. V závislosti od množstva vo vzorke môže byť voľným okom viditeľná DNA. Nezabúdajte však, že tento jednoduchý postup nemusí nevyhnutne viesť k vysokej čistote DNA.
Rastlinné a živočíšne bunky
Rastlinné bunky sa líšia od živočíšnych buniek vďaka svojej tuhej bunkovej stene a organelám, ako je chloroplast. Obsahujú tiež proteíny a enzýmy, ktoré hrajú úlohu vo fotosyntéze. Niektoré rastlinné bunky majú polyploidiu, čo znamená, že majú viac ako jednu kópiu každého chromozómu na bunku. Okrem toho bunkové procesy vyskytujúce sa v rastlinách, ako je fotosyntéza, produkujú celý rad sekundárnych metabolitov. Živočíšne bunky nemajú bunkovú stenu, ale stále potrebujú chemikálie, ako je dodecylsulfát sodný (SDS), aby narušili bunkovú membránu a uvoľnili genomickú DNA.
Extrakcia rastlinnej DNA
Rastlinná genómová DNA sa ťažšie extrahuje z dôvodu bunkovej steny rastliny. Môžete ho odstrániť homogenizáciou alebo pridaním celulázy, aby sa degradovala celulóza, ktorá tvorí bunkovú stenu. Okrem toho môžu metabolity prítomné v rastlinnej bunke interferovať s extrakciou genómovej DNA kontamináciou vzorky DNA počas procesu zrážania.
Extrakcia živočíšnej DNA
Leukocyty periférnej krvi sú hlavným zdrojom živočíšnej genomickej DNA, ale odber vzoriek je zložitý, pretože krv musí pochádzať priamo zo zvieraťa. Krv obsahuje celý rad látok, ako sú proteíny, lipidy, biele krvinky, červené krvinky, krvné doštičky a plazma, ktoré môžu kontaminovať vzorku DNA. Primárnym kontaminantom živočíšnej DNA extrahovanej zo vzoriek krvi je však hem, ktorý je neproteínovou zložkou hemoglobínu.
Rozdiely v DNA
Rozdiely medzi rastlinnou a živočíšnou DNA spočívajú v sekvencii báz v helixe. Zlúčeniny nájdené v rastlinných bunkách v živočíšnych bunkách chýbajú a bázové sekvencie DNA to odrážajú. Genómová rastlinná DNA je tiež často väčšia ako živočíšna DNA. Tieto rozdiely tiež ovplyvňujú extrakčné metódy, výťažok a čistotu DNA.